Руководителями отдела минералогии с 1937 года являлись выдающиеся ученые А.Е.Ферсман, С.М.Курбатов, Н.А.Смольянинов,
Д.И.Щербаков, П.И.Лебедев, Ф.В.Чухров, Н.В.Петровская, М.И.Новгородова,Н.Н.Мозгова, А.С.Марфунин, Д.В.Рундквист. До 1935 года в состав Отдела входила Лаборатория кристаллографии (рук. А.В.Шубников), включающая группы по изучению кристаллогенеза (Г.Г.Леммлейн), кристаллизации из расплавов (С.К.Попов) и растворов (Н.Н.Шефталь); ренгенографическая и ультраакустическая группы. В 1935 г. был создан сектор кристаллографии, в 1937 году преобразованный в самостоятельную лабораторию и позднее, в 1948 году, в Институт кристаллографии Академии наук.
В послевоенный период для аналитического обеспечения минералогических исследований в Отделе были созданы группы инфракрасной спектроскопии (Е.С. Рудницкая), изотопного анализа, парамагнитного резонанса (А.С.Марфунин), лаборатория электронной микроскопии и электронографии (Б.Б.Звягин, Г.С.Грицаенко, А.И.Горшков, Н.М.Попов), лаборатория рентгеноструктурного анализа (Н.Н.Слуцкая, С.И.Берхин, Г.Б.Бокий).
Сотрудниками отдела минералогии в разное время являлись такие видные исследователи, как Э.М.Бонштедт-Куплетская, Е.Е.Костылева-Лабунцова, О.М.Шубникова, В.С.Мясников, С.Д.Попов, Ф.И.Рукавишников, И.Д.Борнеман-Старынкевич, Л.М.Лебедев.